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Téléchargement du logiciel STACOMI R
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Version 0.4.1
- Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.15.2/stacomiR_0.4.1.zip dernière mise à jour 05/02/2013
- vous pouvez aussi les télécharger sur Rforge en tappant install.packages("stacomiR", repos="http://R-Forge.R-project.org") 09/03/2013
- Attention il faut mettre à jour le schema ref, voir avec Cédric.
- R 2.14.1 Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR_0.4.zip dernière mise à jour 10/02/2012
- Les sources sont ici pour le package stacomirtools : source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools_0.2.zip dernière mise à jour 10/02/2012
- - dans R cliquez sur package > installer des packages depuis des fichier zip.. et pointer vers stacomiR_0.4.1.zip
- - télécharger les dépendances (les packages utilisés par le logiciel) en tappant sous R le script qui suit
libraries=function() { necessary = c( 'RODBC','ggplot2','gWidgets' ,'R2HTML','gWidgetsRGtk2', 'lattice','RColorBrewer','xtable','stringr','scales','reshape2','grid','stacomirtools') if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package'])) install.packages(necessary[!necessary %in% installed.packages()[, 'Package']], dep = T) } libraries()
Attention au premier lancement Rgtk, R va télécharger GTK+ (programme graphique de l'interface), il faut relancer R, sur certaines machines, il faut relancer l'ordi. Les packages devraient être téléchargés et installés par R
Test de l'installation
Vous n'avez pas la dernière version de R ? Mettre à jour depuis une ancienne version de R
Pour utiliser les téléchargements ci dessus vous devez avoir une version à jour de R. Voici la procédure pour avoir tout ce qu'il faut dans cette version
- Téléchargez et Installez la nouvelle version
- Copiez les dossier contenus dans le sous dossier library de R dans la nouvelle version (en prenant soin de ne pas écraser les library qui sont déjà là...)
- puis dans R tappez
update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)
Autres liens (pour cédric)
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR-manual.pdf
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools-manual.pdf
- windows 7 si vous avez un fichier nommé c:/program files (x86)) : source:trunk/sources/0.3/R2.10.1x86/stacomiR_0.3.1605.zip
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR_0.4.tar.gz
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools_0.2.tar.gz
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomirtools_0.2.zip dernière mise à jour 10/02/2012
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomiR_0.4.zip dernière mise à jour 10/02/2012
- source:trunk/sources/0.4/R3.0.1/
- source:trunk/sources/0.4/R3.0.2/
install.packages("stacomirtools", repos="http://R-Forge.R-project.org")