wiki:StacomiR Download

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Téléchargement du logiciel STACOMI R

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  1. Téléchargement du logiciel STACOMI R
  2. Version 0.4.1
    1. téléchargement version R 2.14.1
    2. si la méthode ci dessus ne marche pas
    3. Test de l'installation
    4. Vous n'avez pas la dernière version de R ? Mettre à jour depuis une …
    5. Autres liens (pour cédric)

Version 0.4.1

téléchargement version R 2.14.1

  • dans R tapper 
    install.packages("stacomiR", repos="http://R-Forge.R-project.org")

Et R se chargera de télécharger les dépendances. Attention il peut y avoir des problèmes de construction du package sur R forge....

si la méthode ci dessus ne marche pas

  • Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.15.2/stacomiR_0.4.1.zip dernière mise à jour 05/02/2013
    1. - dans R cliquez sur package > installer des packages depuis des fichier zip.. > et pointer vers ggplot2usr.zip
    2. - idem pour stacomi.zip
    3. - télécharger les dépendances (les packages utilisés par le logiciel) en tappant sous R le script qui suit 
      libraries=function() {
necessary = c( 'RODBC','ggplot2','gWidgets' ,'R2HTML','gWidgetsRGtk2',
'lattice','RColorBrewer','xtable','stringr','scales','reshape2','grid')
if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package']))
install.packages(necessary[!necessary %in% installed.packages()[, 'Package']], dep = T)
require('ggplot2')
require('gWidgets')
require('RODBC')
options(guiToolkit = "RGtk2")
require('lattice')
require('RColorBrewer')
require('xtable')
require('stringr')
require('grid')
require('reshape2')
require('scales')
}
libraries()

Les packages devraient être téléchargés et installés par R

Test de l'installation

StacomiR TestInstall

Vous n'avez pas la dernière version de R ? Mettre à jour depuis une ancienne version de R

Pour utiliser les téléchargements ci dessus vous devez avoir une version à jour de R. Voici la procédure pour avoir tout ce qu'il faut dans cette version

  • Téléchargez et Installez la nouvelle version
  • Copiez les dossier contenus dans le sous dossier library de R dans la nouvelle version (en prenant soin de ne pas écraser les library qui sont déjà là...)
  • puis dans R tappez 
    update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)

Autres liens (pour cédric)