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Téléchargement du logiciel STACOMI R
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Version 0.4
téléchargement version R 2.14.1
- dans R tapper
install.packages("stacomiR", repos="http://R-Forge.R-project.org")
Et R devrait se charger de tout. Attention il peut y avoir des problèmes de construction du package sur R forge....
si la méthode ci dessus ne marche pas
- Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR_0.4.zip dernière mise à jour 10/02/2012
- Les sources sont ici pour le package stacomirtools : source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools_0.2.zip dernière mise à jour 10/02/2012
- Depuis la version R 2.14.1 le package xml n'est plus disponible en téléchargement pour windows. J'ai fait une copie ici, il faut aussi l'installer à la main source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/XML_3.9-4.1.zip (mise à jour depuis url:http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/2.14/)
- - dans R cliquez sur package > installer des packages depuis des fichier zip.. > et pointer vers ggplot2usr.zip
- - idem pour stacomi.zip
- - télécharger les dépendances (les packages utilisés par le logiciel) en tappant sous R le script qui suit
libraries=function() { necessary = c('tcltk2', 'RODBC','ggplot2','gWidgets' ,'R2HTML','gWidgetsRGtk2', 'lattice','RColorBrewer','Rcmdr','proto','xtable','XML','svMisc','Hmisc','stringr') if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package'])) install.packages(necessary[!necessary %in% installed.packages()[, 'Package']], dep = T) require('tcltk2') require('ggplot2') require('gWidgets') require('RODBC') require('Hmisc') options(guiToolkit = "RGtk2") require('lattice') require('RColorBrewer') require('ggplot2usr') require('proto') require('xtable') #require('Hmisc') require('XML') require('svMisc') require('stringr') } libraries()
Les packages devraient être téléchargés et installés par R
Test de l'installation
Vous n'avez pas la dernière version de R ? Mettre à jour depuis une ancienne version de R
Pour utiliser les téléchargements ci dessus vous devez avoir une version à jour de R. Voici la procédure pour avoir tout ce qu'il faut dans cette version
- Téléchargez et Installez la nouvelle version
- Copiez les dossier contenus dans le sous dossier library de R dans la nouvelle version (en prenant soin de ne pas écraser les library qui sont déjà là...)
- puis dans R tappez
update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)
Autres liens (pour cédric)
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR-manual.pdf
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools-manual.pdf
- windows 7 si vous avez un fichier nommé c:/program files (x86)) : source:trunk/sources/0.3/R2.10.1x86/stacomiR_0.3.1605.zip
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR_0.4.tar.gz
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools_0.2.tar.gz
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomirtools_0.2.zip dernière mise à jour 10/02/2012
- source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomiR_0.4.zip dernière mise à jour 10/02/2012
install.packages("stacomirtools", repos="http://R-Forge.R-project.org")