Téléchargement du logiciel STACOMI R

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Version 0.4

téléchargement version R 2.14.1

• dans R tapper

  install.packages("stacomiR", repos="http://R-Forge.R-project.org")
  

Et R devrait se charger de tout. Attention il peut y avoir des problèmes de construction du package sur R forge....

si la méthode ci dessus ne marche pas

• Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomiR_0.4.zip dernière mise à jour 26/01/2012
• Les sources sont ici pour le package stacomirtools : source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomirtools_0.2.zip dernière mise à jour 09/01/2012

1. - dans R cliquez sur package > installer des packages depuis des fichier zip.. > et pointer vers ggplot2usr.zip
2. - idem pour stacomi.zip
   
3. - télécharger les dépendances (les packages utilisés par le logiciel) en tappant sous R le script qui suit

   libraries=function() {
   necessary = c('tcltk2', 'RODBC','ggplot2','gWidgets' ,'R2HTML','gWidgetsRGtk2',
   'lattice','RColorBrewer','Rcmdr','proto','xtable','XML','svMisc','Hmisc','stringr')
   if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package']))
   install.packages(necessary[!necessary %in% installed.packages()[, 'Package']], dep = T)
   require('tcltk2')
   require('ggplot2')
   require('gWidgets')
   require('RODBC')
   require('Hmisc')
   options(guiToolkit = "RGtk2")
   require('lattice')
   require('RColorBrewer')
   require('ggplot2usr')
   require('proto')
   require('xtable')
   #require('Hmisc')
   require('XML')
   require('svMisc')
   require('stringr')
   }
   libraries()
   

Les packages devraient être téléchargés et installés par R

Test de l'installation

StacomiR TestInstall

Vous n'avez pas la dernière version de R ? Mettre à jour depuis une ancienne version de R

Pour utiliser les téléchargements ci dessus vous devez avoir une version à jour de R. Voici la procédure pour avoir tout ce qu'il faut dans cette version

• Installer la nouvelle version
• Copier les dossier contenus dans le sous dossier library de R dans la nouvelle version (en prenant soin de ne pas écraser les library téléchargées par défaut, pas besoin)
• puis dans R tapper

  update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)
  

Autres liens (pour cédric)

source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomiR-manual.pdf source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomirtools-manual.pdf windows 7 si vous avez un fichier nommé c:/program files (x86)) : source:trunk/sources/0.3/R2.10.1x86/stacomiR_0.3.1605.zip source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomiR_0.4.tar.gz source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomirtools_0.2.tar.gz

install.packages("stacomirtools", repos="http://R-Forge.R-project.org")