wiki:StacomiR Download

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Téléchargement du logiciel STACOMI R

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  1. Téléchargement du logiciel STACOMI R
  2. Version 0.4
    1. téléchargement version R 2.14.1
    2. si la méthode ci dessus ne marche pas
    3. Test de l'installation
    4. mettre à jour depuis une ancienne version de R
    5. Autres liens (pour cédric)

Version 0.4

Avant de tester la version 0.3, d'importants changements doivent être effectués sur la base et un nom d'organisme doit vous être attribué, contactez Cédric

téléchargement version R 2.14.1

  • dans R tapper 
    install.packages("stacomiR", repos="http://R-Forge.R-project.org")

Et R devrait se charger de tout. Attention il peut y avoir des problèmes de construction du package sur R forge....

si la méthode ci dessus ne marche pas

  1. - dans R cliquez sur package > installer des packages depuis des fichier zip.. > et pointer vers ggplot2usr.zip
  2. - idem pour stacomi.zip
  3. - télécharger les dépendances (les packages utilisés par le logiciel) en tappant sous R le script qui suit 
    libraries=function() {
necessary = c('tcltk2', 'RODBC','ggplot2','gWidgets' ,'R2HTML','gWidgetsRGtk2',
'lattice','RColorBrewer','Rcmdr','proto','xtable','XML','svMisc','Hmisc','stringr')
if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package']))
install.packages(necessary[!necessary %in% installed.packages()[, 'Package']], dep = T)
require('tcltk2')
require('ggplot2')
require('gWidgets')
require('RODBC')
require('Hmisc')
options(guiToolkit = "RGtk2")
require('lattice')
require('RColorBrewer')
require('ggplot2usr')
require('proto')
require('xtable')
#require('Hmisc')
require('XML')
require('svMisc')
require('stringr')
}
libraries()

Les packages devraient être téléchargés et installés par R

Test de l'installation

StacomiR TestInstall

mettre à jour depuis une ancienne version de R

Pour utiliser les téléchargements ci dessus vous devez avoir une version à jour de R. Voici la procédure pour avoir tout ce qu'il faut dans cette version

  • Installer la nouvelle version
  • Copier les dossier contenus dans le sous dossier library de R dans la nouvelle version (en prenant soin de ne pas écraser les library téléchargées par défaut, pas besoin)
  • puis dans R tapper 
    update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)

Autres liens (pour cédric)

source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomiR-manual.pdf source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomirtools-manual.pdf windows 7 si vous avez un fichier nommé c:/program files (x86)) : source:trunk/sources/0.3/R2.10.1x86/stacomiR_0.3.1605.zip source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomiR_0.4.tar.gz source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomirtools_0.2.tar.gz 

install.packages("stacomirtools", repos="http://R-Forge.R-project.org")