= Téléchargement du logiciel STACOMI R =
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[[PageOutline]]

= Version 0.4.1 =
* Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.15.2/stacomiR_0.4.1.zip dernière mise à jour 05/02/2013
* vous pouvez aussi les télécharger sur Rforge en tappant install.packages("stacomiR", repos="http://R-Forge.R-project.org") 09/03/2013
* Attention il faut mettre à jour le schema ref, voir avec Cédric.
 * R 2.14.1 Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR_0.4.zip dernière mise à jour 10/02/2012
 * Les sources sont ici pour le package stacomirtools : source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools_0.2.zip dernière mise à jour 10/02/2012
 
 1. - dans R cliquez sur ''' package ''' > ''' installer des packages depuis des fichier zip.. ''' et pointer vers stacomiR_0.4.1.zip
 2. - télécharger les dépendances (les packages utilisés par le logiciel) en tappant sous R le script qui suit
{{{
libraries=function() {
necessary = c( 'RODBC','ggplot2','gWidgets' ,'R2HTML','gWidgetsRGtk2',
'lattice','RColorBrewer','xtable','stringr','scales','reshape2','grid','stacomirtools')
if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package']))
install.packages(necessary[!necessary %in% installed.packages()[, 'Package']], dep = T)
}
libraries()
}}}
Attention au premier lancement Rgtk, R va télécharger GTK+ (programme graphique de l'interface), il faut relancer R, sur certaines machines, il faut relancer l'ordi.
Les packages devraient être téléchargés et installés par R

== Test de l'installation ==

[wiki:"StacomiR TestInstall"]


== Vous n'avez pas la dernière version de R ? Mettre à jour depuis une ancienne version de R ==
Pour utiliser les téléchargements ci dessus vous devez avoir une version à jour de R. Voici la procédure pour avoir tout ce qu'il faut dans cette version
 * Téléchargez et Installez la nouvelle version
 * Copiez les dossier contenus dans le sous dossier library de R dans la nouvelle version (en prenant soin de ne pas écraser les library qui sont déjà là...) 
 * puis dans R tappez
{{{
update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)
}}}


== Autres liens (pour cédric) ==
 * source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR-manual.pdf
 * source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools-manual.pdf
 * windows 7 si vous avez un fichier nommé c:/program files (x86)) : source:trunk/sources/0.3/R2.10.1x86/stacomiR_0.3.1605.zip
 * source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR_0.4.tar.gz
 * source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools_0.2.tar.gz
 * source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomirtools_0.2.zip dernière mise à jour 10/02/2012
 * source:trunk/sources/0.4/R2.14.0/stacomiR_0.4.zip dernière mise à jour 10/02/2012
 * source:trunk/sources/0.4/R3.0.1/stacomiR_0.4.1_R3.0.1.zip 
 * source:trunk/sources/0.4/R3.0.2/
{{{
install.packages("stacomirtools", repos="http://R-Forge.R-project.org")
}}}