Changes between Version 48 and Version 49 of StacomiR Download


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Feb 28, 2013 1:50:31 PM (12 years ago)
Author:
brice
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  • StacomiR Download

    v48 v49  
    44 
    55= Version 0.4.1 = 
    6 == téléchargement version R 2.14.1 == 
    7  * dans R tapper  
    8 {{{ 
    9 install.packages("stacomiR", repos="http://R-Forge.R-project.org") 
    10 }}} 
    11 Et R se chargera de télécharger les dépendances. Attention il peut y avoir des problèmes de construction du package sur R forge.... 
    12 == si la méthode ci dessus ne marche pas == 
    136* Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.15.2/stacomiR_0.4.1.zip dernière mise à jour 05/02/2013 
    147 * Les sources sont ici pour le package stacomi : source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomiR_0.4.zip dernière mise à jour 10/02/2012 
    158 * Les sources sont ici pour le package stacomirtools : source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/stacomirtools_0.2.zip dernière mise à jour 10/02/2012 
    16  * Depuis la version R 2.14.1 le package xml n'est plus disponible en téléchargement pour windows. J'ai fait une copie ici, il faut aussi l'installer à la main  source:trunk/sources/0.4/R2.14.1/XML_3.9-4.1.zip (mise à jour depuis [http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin/bin/windows/contrib/2.14/, stats.ox.ac.uk]) 
    17  1. - dans R cliquez sur ''' package ''' > ''' installer des packages depuis des fichier zip.. ''' > et pointer vers ggplot2usr.zip 
    18  2. - idem pour stacomi.zip [[BR]] 
    19  3. - télécharger les dépendances (les packages utilisés par le logiciel) en tappant sous R le script qui suit 
     9  
     10 1. - dans R cliquez sur ''' package ''' > ''' installer des packages depuis des fichier zip.. ''' et pointer vers stacomiR_0.4.1.zip 
     11 2. - télécharger les dépendances (les packages utilisés par le logiciel) en tappant sous R le script qui suit 
    2012{{{ 
    2113libraries=function() { 
    2214necessary = c( 'RODBC','ggplot2','gWidgets' ,'R2HTML','gWidgetsRGtk2', 
    23 'lattice','RColorBrewer','xtable','stringr','scales','reshape2','grid') 
     15'lattice','RColorBrewer','xtable','stringr','scales','reshape2','grid','stacomirtools') 
    2416if(!all(necessary %in% installed.packages()[, 'Package'])) 
    2517install.packages(necessary[!necessary %in% installed.packages()[, 'Package']], dep = T) 
    26 require('ggplot2') 
    27 require('gWidgets') 
    28 require('RODBC') 
    29 options(guiToolkit = "RGtk2") 
    30 require('lattice') 
    31 require('RColorBrewer') 
    32 require('xtable') 
    33 require('stringr') 
    34 require('grid') 
    35 require('reshape2') 
    36 require('scales') 
    3718} 
    3819libraries() 
    3920}}} 
     21Attention au premier lancement Rgtk, R va télécharger GTK+ (programme graphique de l'interface), il faut relancer R, sur certaines machines, il faut relancer l'ordi. 
    4022Les packages devraient être téléchargés et installés par R 
    4123