Bilan des Stades Pigmentaires

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Les bilans de stades pigmentaires ont été développés pour permettre de visionner l'évolution de la structure en stades pigmentaires des civelles . L'application utilise les paramètres du modèle de Briand et al. , 2005 pour retrocalculer la date d'arrivée probable des civelles. ​http://www3.interscience.wiley.com/journal/118686679/abstract mais l'article est disponible dans ma thèse ​http://www.eptb-vilaine.fr/site/index.php/publications-scientifiques/46-publications-migrateurs/60-dynamique-de-population-et-de-migration-des-civelles-en-estuaire-de-vilaine. L'évolution dans le temps des stades pigmentaires est modélisée à l'aide de fonctions gamma qui utilisent un temps pigmentaire basé sur la température et la salinité. La température a un rôle majeur sur l'évolution pigmentaire des civelles, la salinité la ralentit un peu.
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Les choix possibles sont dans l'ordre :

• Choix de la largeur des distribution (conditionne la largeur maximale des enveloppes de rétrocalcul du temps pigmentaire
• Options du graphique
  • graphstade => le graphique donnant le pourcentage cumulé des différents stades
  • retrocalcul => affichage d'un retrocalcul de la date d'arrivée probable des différents stades, vous pouvez la décocher si vous ne souhaitez que le graphique des stades, si par exemple vous n'avez pas températures
  • points => affichage des points correspondants aux valeurs des différents stades (pour plus de clarté et permettre de visualiser les différents points si les échantillons sont nombreux.
  • nb => affichage de l'effectif des différents échantillons de stades pigmentaires sur le graphe.
• Valeur de la salinité moyenne
• Choix de la température => choisissez parmi vos stations de mesure celle qui correspond à la température rencontrée par les civelles, les valeurs manquantes ne sont pas permises
• Choix du dispositif de comptage (celui sur lequel vous avez des structures en stades)

référence : BRIAND C., FATIN D., CICCOTTI E. and LAMBERT P., 2005. A stage-structured model to predict the effect of temperature and salinity on glass eel Anguilla anguilla pigmentation development. J Fish Biol, 67, 995-1009.