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Suppression des variables non nécessaires
Pour l'utilisation des données de pêche de BDMAP dans le modèle, différentes variables ont été supprimées compte tenu d'un grand nombre de données manquantes NA
Suppresion de : op_listeespecescibles, op_longprospdroit, op_longprospgauche, op_longsdt, op_largprospdroit, op_largprospgauche, op_nbrsondage, op_nbrzones, st_distancemer, op_largsdt, ta_code.
Sélection du jeu de données :
avec :
- Méthode de pêche complète (ers_full$op_cd_methodeprospection=="843")
- Deux passages (simple$op_nbrpassage==2&!is.na(simple$op_nbrpassage))
- Année > 1983
- Mois d'avril à novembre
- lotG = TRUE
- effort connu (suppression des efforts notés NA)
- effort <=3000 m
- station avec transport de civelles supprimées (st_codecsp : '04410033','04180035','04180047','04450013','04030012')
--> 2907 lignes, 100 stations
Nombre de pêches effectuées par années
1984 | 1985 | 1986 | 1987 | 1988 | 1989 | 1990 | 1991 | 1992 | 1993 | 1994 | 1995 | 1996 | 1997 | 1998 | 1999 | 2000 | 2001 | 2002 | 2003 | 2004 | 2005 | 2006 | 2007 | 2008 |
48 | 64 | 48 | 48 | 61 | 60 | 85 | 127 | 116 | 96 | 79 | 126 | 143 | 152 | 149 | 145 | 168 | 147 | 156 | 154 | 155 | 156 | 163 | 132 | 129 |
Nombre de pêches par moyens de prospection
A pied | En bateau | Non renseigne |
2891 | 14 | 2 |
--> suppression des moyens de prospection : En bateau et Non renseigne
avec :
- Méthode de pêche complète (simple$op_cd_methodeprospection=="843")
- Deux passages (simple$op_nbrpassage==2&!is.na(simple$op_nbrpassage))
- Année > 1983
- Mois d'avril à novembre
- lotG = TRUE
- effort connu (suppression des efforts notés NA)
- effort <=3000 m
- station sans transport de civelles (st_codecsp : '04410033','04180035','04180047','04450013','04030012'supprimées)
- moyen prospection ="A pied"
--> 8920 opérations de pêches, 3847 stations
### A voir suivant l'objectif de pêche ce que l'on conserve ou pas
#Problème (?): Pour un même gid plusieurs codestation (st_codecsp)
length(levels(as.factor(simple2$gid)))
length(levels(as.factor(simple2$st_codecsp)))
Parfois pour une même année, pour un gid, plusieurs code station.
gid | st_codecsp |
328924 | 06260114, 06260115 |
331132 | 04420102, 04420103, 04420152, 04420161 |
325312 | 05480032,05480033, 05480034 |
225914 | 03140157,03140146 |
227829 | 04420413, 04420363, 04420027,04420261 |
...
#Pour le calcul de winter et summer, une station n'a pas de données : st_codecsp=062B0100 et gid=158080
Elle correspond à une station située en Corse du Nord
# Plusieurs gid sans cum_len_sea (NA)