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Suppression des variables non nécessaires

Pour l'utilisation des données de pêche de BDMAP dans le modèle, différentes variables ont été supprimées compte tenu d'un grand nombre de données manquantes NA
Suppresion de : op_listeespecescibles, op_longprospdroit, op_longprospgauche, op_longsdt, op_largprospdroit, op_largprospgauche, op_nbrsondage, op_nbrzones, st_distancemer, op_largsdt, ta_code.

Sélection du jeu de données :

avec :

• Méthode de pêche complète (ers_full$op_cd_methodeprospection=="843")
• Deux passages (ers$op_nbrpassage==2&!is.na(ers$op_nbrpassage))
• Année > 1983
• Mois d'avril à novembre
• lotG = TRUE
• effort connu (suppression des efforts notés NA)
• effort <=3000 m
• station avec transport de civelles supprimées (st_codecsp : '04410033','04180035','04180047','04450013','04030012')

--> 2907 lignes, 100 stations

Nombre de pêches effectuées par années

1984	1985	1986	1987	1988	1989	1990	1991	1992	1993	1994	1995	1996	1997	1998	1999	2000	2001	2002	2003	2004	2005	2006	2007	2008
48	64	48	48	61	60	85	127	116	96	79	126	143	152	149	145	168	147	156	154	155	156	163	132	129

Nombre de pêches par moyens de prospection

A pied	En bateau	Non renseigne
2891	14	2

--> suppression des moyens de prospection : En bateau et Non renseigne

avec :

• Méthode de pêche complète (ers$op_cd_methodeprospection=="843")
• Deux passages (ers$op_nbrpassage==2&!is.na(ers$op_nbrpassage))
• Année > 1983
• Mois d'avril à novembre
• lotG = TRUE
• effort connu (suppression des efforts notés NA)
• effort <=3000 m
• station sans transport de civelles (st_codecsp : '04410033','04180035','04180047','04450013','04030012'supprimées)
• moyen prospection ="A pied"

--> 8920 opérations de pêches, 3847 stations

### A voir suivant l'objectif de pêche ce que l'on conserve ou pas

#Problème (?): Pour un même gid plusieurs codestation (st_codecsp)
length(levels(as.factor(ers2$gid)))
length(levels(as.factor(ers2$st_codecsp)))

Parfois pour une même année, pour un gid, plusieurs code station.

gid	st_codecsp
328924	06260114, 06260115
331132	04420102, 04420103, 04420152, 04420161
325312	05480032,05480033, 05480034
225914	03140157,03140146
227829	04420413, 04420363, 04420027,04420261

...

#Pour le calcul de winter et summer, une station n'a pas de données : st_codecsp=062B0100 et gid=158080
Elle correspond à une station située en Corse du Nord

# Plusieurs gid sans cum_len_sea (NA)

#Sélection de la méthode de prospection (suivant les UGA)

% de relevés	complète	ambiances	partielle sur berges	traits	EPA	Stratifiée par Points (grand milieu)	faciès	partielle sur toute la largeur	placettes	autres
Adour	0,463	0,080	0,121	0,176	0,017	0,081	0,008	0,039	0	0,016
ArtoisPicardie	0,344	0,362	0,048	0,075	0,009	0,111	0,048	0,005	0	0
Bretagne	0,781	0,033	0,037	0	0,005	0,059	0,075	0,002	0	0,008
Corse	0,862	0,004	0,004	0	0	0,131	0	0	0	0
Garonne	0,702	0,118	0,048	0	0,009	0,075	0,015	0,018	0	0,015
Loire	0,699	0,089	0,047	0,001	0,000	0,075	0,015	0,002	0	0,070
Meuse	0,328	0,123	0,385	0	0	0,042	0,001	0,116	0,004	0
Rhin	0,287	0,080	0,533	0	0,003	0,030	0,000	0,065	0,001	0
RhoneMediterranee	0,790	0,100	0,012	0	0,002	0,069	0,014	0,005	0,001	0,009
SeineNormandie	0,465	0,167	0,215	0,020	0	0,061	0,024	0,040	0,000	0,007

#Pourcentage de relevés conservés dans ers et nombre de relevés par uga

Adour	27.4%	nb=210
ArtoisPicardie	20.5	91
Bretagne	61.6	778
Corse	76.6	199
Garonne	53	1443
Loire	49.7	1963
Meuse	3.3	27
Rhin	2.2	51
RhoneMediterranee	61.9	2982
SeineNormandie	27	1186